La Comisión Nacional de Estadística judicial tiene su origen en el artículo 461.3 de la LOPJ que establece que:

La Comisión Nacional de Estadística Judicial, integrada por el Ministerio de Justicia, una representación de las Comunidades Autónomas con competencias en la materia, el Consejo General del Poder Judicial y la Fiscalía General del Estado, aprobará los planes estadísticos, generales y especiales, de la Administración de Justicia y establecerá criterios uniformes y de obligado cumplimiento para todos sobre la obtención, tratamiento informático, transmisión y explotación de los datos estadísticos del sistema judicial español.

La estructura, composición y funciones de la Comisión Nacional de Estadística Judicial está regulada por el Real Decreto 1184/2006, de 13 de octubre.  La Comisión funciona en Pleno y en Comisión Técnica y tiene una presidencia y secretaria rotatoria, por dos años, entre el Ministerio de Justicia y el Consejo General del Poder judicial. La Comisión Nacional de Estadística Judicial se constituyó formalmente el 17 de mayo de 2007.