El CGPJ dispone en la actualidad de cuatro edificios públicos que le sirven de sede. Dos de ellos se encuentran en Madrid, uno en Barcelona y el otro en Donostia-San Sebastián.

• Sede Principal

Situada en la calle Marqués de la Ensenada, 8 (28004-Madrid). Fue inaugurada el día 13 de septiembre de 1990 por S.M. el Rey Juan Carlos I.

El CGPJ ocupó previamente dos sedes provisionales. Una primera, en el edificio que alberga la Audiencia Nacional (calle García Gutiérrez número 1 de Madrid), donde estuvo el Consejo hasta septiembre de 1981. Una segunda en el Paseo de la Habana números 140-142 de Madrid, donde el CGPJ permaneció hasta su traslado definitivo a su actual ubicación.

• Atención al Ciudadano y Formación Continua

Situada en la calle Trafalgar 27-29, de Madrid, esta segunda sede alberga al Servicio de Formación Continua de la Escuela Judicial, el Servicio de Inspección y la Oficina de Atención al Ciudadano. 

• Escuela Judicial

Está situada en una finca de la montaña de Collserola, denominada "La Esperança", en el antiguo municipio de San Gervasi de Casoles, hoy de Barcelona. Esta instalación singular tiene tres partes claramente identificadas. Una primera, sobre un volumen ya existente, que se ha destinado, siguiendo una esmerada rehabilitación, a despachos para la dirección y administración de la Escuela Judicial, así como a la biblioteca. La segunda, de nueva planta, aloja las aulas y el auditorio. La tercera, también de nueva planta, está destinada a servicios comunes y comunica las dos anteriores. La finca es propiedad de la Generalidad de Cataluña que cedió su uso a la Administración General del Estado para ubicar la Escuela Judicial del CGPJ por un plazo de treinta años.

• Centro de Documentación Judicial (Cendoj)

Ubicado en el Palacio de la Audiencia Provincial de San Sebastián, en la calle San Martín. Se trata de un edificio clásico, inaugurado en 1916, de planta rectangular y construida con piedra de sillería. Es obra del arquitecto donostiarra José Gurruchaga y Martiarena, quien optó por el dominio de espaciosos huecos abiertos, grandes vidrieras y líneas rectas. El Gobierno de la Comunidad Autónoma del País Vasco ha cedido su uso a título gratuito al CGPJ, por cincuenta años para albergar la sede del Cendoj.