El Cendoj participa activamente en la elaboración, organización y mantenimiento de las siguientes herramientas:

El Prontuario de Auxilio Judicial Internacional es una herramienta en cuya elaboración participan los miembros de la Red Judicial Española (REJUE), la cual recoge los convenios internacionales y otras normas jurídicas aplicables a las relaciones jurídicas de cooperación entre los distintos Estados. Constituye un instrumento o guía de uso sencillo y ágil, para dar respuesta a las cuestiones que se pueden generar en un proceso de índole Civil o Penal.
En él se facilitan los formularios a utilizar para realizar comisiones rogatorias y se proporciona información sobre instituciones que pueden ofrecer un apoyo suplementario, así como un directorio de contactos.
Prevé tanto la actuación activa (solicitud en el ámbito de un proceso tramitado por un órgano judicial español), como la pasiva (recepción de una solicitud procedente de un Estado extranjero).

Elabora y mantiene activa la base de datos que recoge las cuestiones prejudiciales planteadas por los órganos judiciales españoles ante el Tribunal de Justicia de la Unión Europea, seleccionadas por los miembros de la Red de Expertos en Derecho de la Unión Europea (REDUE).
Contiene las diferentes resoluciones dictadas durante el proceso, en el orden en que se emiten, junto con valores añadidos, agregados por el Cendoj.
La base de datos está acompañada de información general sobre el procedimiento de planteamiento de las cuestiones prejudiciales en los cinco órdenes jurisdiccionales en los que trabaja esta red: civil, mercantil, contencioso-administrativo, social y penal.

Además, participa en la difusión y publicación de La REDUE informa: contiene los boletines elaborados por los miembros de la REDUE sobre novedades en materias de aplicación del Derecho Europeo.

Finalmente, también coordina la publicación y mantenimiento de la base cuestiones prejudiciales extranjeras.