El Tribunal Superior de Justícia està format per les Sales següents: de les causes Civils i Penals, de les causes Contencioses Administratives i de les causes Socials.

 El componen un President, que també ho és de la Sala Civil i Penal, dels Presidents de Sala i dels Magistrats que la llei determini per a cadascuna de les Sales i, en el seu cas, de les Seccions que s'hi puguin crear.

El president del Tribunal Superior de Justícia té la consideració de magistrat del Tribunal Suprem i és el màxim representant del poder judicial a la Comunitat Autònoma del País Basc. És nomenat pel Consell General del Poder Judicial por un període de cinc anys. Durant el seu mandat compatibilitza les tasques governatives i representatives del càrrec amb les funcions jurisdiccionals com a president de la Sala Civil i Penal de l’Alt Tribunal.

És també president de la Junta Electoral de la comunitat autònoma basca i president de la Comissió Arbitral establerta en l’article 34 de l’Estatut de Gernika, per dirimir els conflictes de competència que se suscitin entre les institucions de la comunitat autònoma i les de cadascun dels seus territoris històrics.

El president del Tribunal Superior de Justícia del País Basc és el magistrat D. Ignacio José Subijana Zunzunegui.