La Sala de Govern és el màxim òrgan de govern intern de l'Administració de justícia al País Basc.

Està integrada pel president del Tribunal, els presidents de la resta de sales de justícia d'aquell mateix Tribunal, el president de les audiències provincials d'Àlaba, Biscaia i Guipúscoa, el jutge degà de Bilbao i un nombre igual de magistrats i jutges escollits pels membres de la carrera judicial que presten els seus serveis a la comunitat autònoma. Un d'ells té la categoria de jutge. També forma part d'aquesta Sala el secretari de Govern del TSJPB.

Les sales de govern es reuneixen, almenys, dues vegades per mes, tret que no hi hagi assumptes pendents, i totes les vegades, a més, que hagin de tractar assumptes urgents d’interès per a l’Administració de justícia, quan ho consideri necessari el president del Tribunal Superior de Justícia, quan ho soiciti la tercera part dels seus membres mitjançant una proposta raonada i amb expressió del que hagi de ser objecte de deliberació i decisió, o quan ho soiciti el secretari de Govern a fi de tractar qüestions que afectin oficines judicials o secretaris judicials que en depenguin. La convocatòria la fa el president, amb expressió dels assumptes que s’han de tractar.