La période de l’Ecole Judiciaire commence avec la reforme de la Loi Organique du Pouvoir Judiciaire de 1995 par laquelle la matière de formation de juges, avant dans le domaine du Ministère de Justice, est transférée au CGPJ. La formation initiale est réalisée par la première fois au siège de Barcelone avec la promotion 48^ème, au mois de février 1997.

À partir de ce moment les suivantes promotions se composent uniquement par juges, car les procureurs suivent leur procès de formation à l’ancienne siège du Ministère de Justice, placée à la Cité Universitaire de Madrid, et sous le nom de Centre d’Études Juridiques (CEJ), ou on fait aussi la formation du secrétaires judiciaires, avocats de l’état, et d’autres entités, et entités juridiques à caractère national gérées depuis le domaine gouvernemental.

Depuis la fin du siècle XIX, différents projets gouvernementaux considéraient la création d’une Ecole Judiciaire comme garantie du bon service aux citoyens. Le Decret du 22 septembre de 1836 créa « l’Assemblée de qualification de magistrats et juges », « pour préparer l’organisation judiciaire, pour le moment où il soit nécessaire de la faire au sujet du principe de l’inamobilité ». Fernando de los Ríos, ministre de justice au début de la deuxième République inclut la création de l’EJ dans son programme de gouvernement ».

La création effective de l’École Judiciaire ne se produit pas jusqu’à la Loi du 26 avril du 1944. Son premier directeur, en 1947, fut Plaza Navarro, qui la qualifia comme « une prudente réaction contre l’admission par concours ». Dans l’exposition de raisons de la norme qui la créa, il est expliqué que « l’opposition peut servir à contenir les excès du faveur, mais il n’est pas assez pour garantir la formation complète des futurs titulaires pour une fonction qui exige des vertus vérifiées ».

Dans sa configuration ancienne l’EJ fut un organisme du Ministère de Justice, qui dirigea 47 promotions de juges (entre 1947 et 1996, en formation partagé avec les procureurs. A partir de 1997 il commença l’étape de la EJ au sein du CGPJ, avec la promotion 48^ème, et jusqu’à la présente. Dans cette période les directeurs de l’EJ ont été : Jesús Corbal, Carlos Gómez Martínez, José Francisco Valls Gombau, Nuria Bassols et Pascual Ortuño.