El Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria és la màxima expressió del Poder Judicial a la comunitat autònoma. Es va constituir el 23 de maig de 1989 com a òrgan integrant de l'estructura judicial. Els Tribunals Superiors de Justícia sorgeixen de la planta que preveu l'article 26 de la Llei orgànica del poder judicial.

Com a màxim òrgan del poder judicial dins de la comunitat autònoma, exerceix funcions governatives a través de la Sala de Govern.

Com a tribunal de Justícia, exerceix jurisdicció a través de tres Sales de Justícia:

• Sala civil i penal
• Sala contenciosa administrativa
• Sala social

La Sala civil i penal del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria coneix de les causes penals contra els ciutadans aforats i de la instrucció i la decisió de les causes obertes contra jutges, magistrats i membres del Ministeri Fiscal per delictes o faltes comesos en l'exercici del seu càrrec, sempre que aquesta atribució no correspongui al Tribunal Suprem.

A més, coneix dels recursos d'apel•lació contra les resolucions dictades en primera instància per l'Audiència Provincial i de les qüestions de competència entre òrgans jurisdiccionals penals amb seu a la regió que no tinguin un altre òrgan superior comú.

Aquesta Sala es troba a l'antic convent del Complex Judicial de Las Salesas, a Santander.

Per la seva part, la Sala contenciosa administrativa del Tribunal Superior de Justícia és l'òrgan fiscalitzador de les administracions públiques a Cantàbria. Coneix dels recursos relatius als actes de les entitats locals i de la Comunitat Autònoma, de les apel•lacions promogudes contra les resolucions dels jutjats del Contenciós, de les qüestions de competència entre aquests jutjats i dels recursos de cassació per a la unificació de doctrina o en interès de la Llei.

Finalment, la Sala del Social del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria s'encarrega dels processos que afecten els interessos dels treballadors i els empresaris d'àmbit superior als jutjats socials. Entre les seves competències es troben els recursos de súplica contra les resolucions dictades pels jutjats socials del territori i els jutjats mercantils en matèria laboral o en incidents concursals que afectin els treballadors, així com les qüestions de competència entre els jutjats socials de la regió.

Com la resta de sales del Tribunal Superior de Justícia, es troba a l'antic convent del Complex Judicial de Las Salesas, a Santander.
La Sala de Govern és l'òrgan de govern intern dels jutjats i els tribunals de la regió. El seu objectiu principal és organitzar el funcionament diari dels jutjats i dels tribunals de la comunitat autònoma.

La Sala de Govern del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria està integrada per vuit membres i té caràcter representatiu, ja que la meitat d'ells són elegits democràticament pels jutges i els magistrats de la comunitat autònoma. D'aquests quatre membres electes, tres tenen categoria de magistrat i el quart, de jutge.

Completen la Sala de Govern quatre membres nats, és a dir, que ho són en funció del seu càrrec: el president del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria que també ho és de la Sala de Govern, els presidents de la Sala contenciosa administrativa i de la Sala social, i el president de l'Audiència Provincial.

Exerceix de secretari d'aquest òrgan governatiu el secretari de Govern del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria.

La Sala de Govern del Tribunal Superior de Justícia de Cantàbria es reuneix quinzenalment per abordar els assumptes d'organització interna que li atribueix la Llei orgànica del poder judicial.

Té àmplies competències per organitzar el funcionament dels jutjats i els tribunals sota la seva responsabilitat. Entre les seves funcions hi figuren:

• Assegurar que les places de jutges i de magistrats titulars dels òrgans judicials esmentats es trobin cobertes adequadament.
• Analitzar les queixes que plantegin els ciutadans amb relació a l'Administració de justícia.
• Revisar les sancions que imposin els jutges a qui intervinguin en els processos judicials.
• Proposar al president visites d'inspecció.
• Mantenir relacions institucionals amb altres administracions públiques per tal de millorar el funcionament de l'Administració de justícia.
• Elaborar estudis i propostes dirigits al Consell General del Poder Judicial i la memòria anual expositiva sobre el funcionament del Tribunal, que haurà de contenir, en tot cas, la indicació de les mesures que es considerin necessàries per corregir les deficiències advertides.
• Proposar al Consell General del Poder Judicial l'adopció de les mesures que consideri pertinents per millorar l'Administració de justícia quant als òrgans jurisdiccionals respectius.
• Rebre el jurament o la promesa dels magistrats que integren els tribunals respectius i donar-los possessió.
• Promoure davant de l'òrgan competent l'exigència de les responsabilitats disciplinàries que escaigui de secretaris judicials, del personal al servei de l'Administració de justícia o de qualsevol altre que, sense ostentar aquesta condició, hi presti els serveis de forma permanent o ocasional.
• Expedir els nomenaments dels jutges de pau.